În primele declarații după accident, ministrul spaniol al Transporturilor, Óscar Puente, a sugerat că o „eroare umană” ar fi putut contribui la producerea tragediei. El a spus că sistemul de semnalizare LZB s-a defectat în jurul orei 08:30, declanșând oprirea automată a șase trenuri din zonă, iar la câteva minute după aceea centrul de control a autorizat reluarea deplasării unui tren, decizie pe care Puente a numit-o „inexplicabilă” și posibil legată de o greșeală umană.
În paralel, ziarul „El País” a relatat că au rămas nelămurite „cele 17 minute” în care, potrivit reconstrucției, nimeni din centrul de control nu ar fi observat că un tren se apropia de coliziune, ceea ce a alimentat întrebările privind modul în care a fost gestionată situația în timp real.