EU外の市民は、シェンゲンに入る際にEESを通じて登録され、最大90日間の滞在のためにバイオメトリックデータが収集されます。

シェンゲン圏に入る第三国の市民は、国境の通過点でEES（入国/出国システム）を通じて登録されます。このシステムは、初回入国時に写真や指紋を含む生体情報とバイオメトリックデータを収集し、180日間のウィンドウ内で最大90日間シェンゲン圏に滞在できるようにします。その後の入国は、顔の生体認証のみが必要です。

アンタン・ズラタノフ長官は、第三国の市民の登録がヨーロッパ全体の安全性を高めると強調しました。EESシステムは2025年10月12日に実施される予定ですが、最初は登録の10%しか完了しないと見込まれており、夏の間に100%に徐々に増加する見込みです。これにより、初めてシェンゲン圏を通過する人々に長い列や遅延が発生することになりますが、その頃までには問題が解決されると期待されています。EESはインターネットに接続されていないため、データ漏洩のリスクが低減されます。