A nem EU-beli állampolgárokat az EES-en keresztül regisztrálják a Schengen-zónába való belépéskor, biometrikus adatokat gyűjtve legfeljebb 90 napos tartózkodásra.

A Schengen térségbe belépő harmadik országok állampolgárait az EES (Belépési/Kilépési Rendszer) rendszerén keresztül fogják nyilvántartani a határátkelőhelyeken. Ez a rendszer biográfiai és biometrikus adatokat, beleértve fényképeket és ujjlenyomatokat, gyűjt az első belépéskor, lehetővé téve számukra, hogy legfeljebb 90 napig maradjanak Schengenben egy 180 napos időszak alatt. A későbbi belépésekhez csak egy biometrikus arcfelismerés szükséges.

Anton Zlatanov főbiztos hangsúlyozta, hogy a harmadik országok állampolgárainak nyilvántartása növelni fogja a biztonságot európai szinten. Bár az EES rendszert 2025. október 12-én kezdik el bevezetni, előrejelzések szerint kezdetben csak a nyilvántartások 10%-a fog elkészülni, fokozatosan 100%-ra növekedve a nyár folyamán. Ez sorban állásokat és késéseket fog okozni azok számára, akik először lépik át a Schengen határt, de várhatóan a problémákat addigra orvosolják. Az EES nem csatlakozik az internethez, ami csökkenti az adatlopás kockázatát.