E-factura generează costuri și probleme tehnice pentru IMM-uri, fără claritate privind beneficiile pentru bugetul de stat.

De la dificultăți tehnice și costuri suplimentare pentru antreprenori, la întrebări legate de eficiența sistemului în lupta împotriva evaziunii fiscale,e-factura ridică semne de întrebare. Dacă ANAF nu dispune de capacitatea tehnică de a verifica în timp real milioanele de facturi electronice, eforturile de conformare la e-factura vor fi in zadar.